A ideia era imaginar os dois universos dos filmes se fundindo em um só. Para isso, foi criado uma história para contextualizar as imagens:

Em um sistema solar distante, uma batalha entre o bem e o mal começou. Rita Repulsa, a imperatriz do mal, tinha um sonho: ser a única senhora de todo o universo. Sem nunca se cansar, ela tentou controlar a galáxia várias vezes. Em todas as tentativas um gentil sábio chamado Zordon conseguiu impedi-la, mas nunca a derrotou por completo.

Zordon e Rita não poupavam forças, o universo nunca tinha visto tal poder em uma batalha que se estendia por mais de 2000 anos, muitos planetas foram destruídos e todo o sistema solar foi desmantelado.

Porem, Rita ofereceu a Zordon uma trégua. Feliz em terminar essa guerra insana, ele aceitou. Mas tudo era enganação, um plano de Rita para que ele baixasse a guarda. Aproveitando-se da distração, ela o prendeu em um portal interdimensional. Porém, antes de ser sugado Zordon concentrou todo o seu poder em uma lata de lixo galáctica e com a ajuda de seu Robô Alfa-5 conseguiu atrair Rita e seus soldados para o recipiente.

O Robô construiu um centro de controle complexo na Terra, a partir de onde entrou em contato com seu mestre. Os dois sempre estudavam e se planejavam para a possibilidade de Rita escapar da sua prisão. No caso disso acontecer, Zordon iria convocar seus antigos aliados os Autobots que se uniram a ele durante a guerra e cinco adolescentes que iriam se tornar os Power Ranger.

Muitos anos depois, Rita foi acidentalmente liberta por dois astronautas curiosos. Ela então reassumiu seu palácio na Lua e rapidamente descobriu a localização de seu arqui-inimigo. Rita sente uma energia poderosa sendo usada na Terra e ao observar o planeta ela percebe que é o Allspark sendo desintegrado no peito de Megatron, seu antigo aliado que acaba de ser morto. Após sua morte, Optimus Prime diz que seu planeta natal não poderá ser restaurado e transmite uma mensagem para todos os Autobots sobreviventes no espaço avisando-os que a Terra é um novo lar.

Os Decepticons Starscream e Scorponok que sobreviveram à guerra fogem para a Lua quando ouvem o chamado de sua antiga aliada. Por sua vez, Optimus Prime é convocado por Zordon sendo avisado sobre a ameaça de Rita, que foi libertada de sua prisão.